El virus fue aislado por primera vez en 1947, en el bosque de Zika en Uganda y en 1968 fue aislado por primera vez en seres humanos, a partir de una muestra obtenida en Nigeria. De 1951 a 1981, se reportó evidencia de infección en seres humanos en otros países africanos. Actualmente representa en Venezuela  una de las enfermedades con mayor auge en la población.