Las enfermedades parasitarias intestinales constituyen un problema médico, social y económico para la población mundial. Si bien se reconocen numerosas especies capaces de provocar francas enfermedades, otras se consideran comensales, no causales de enfermedad al humano. No obstante, se ha informado la relación de tales parásitos “no patógenos” con diversos trastornos de la salud, tanto en la etiología como en su papel de indicadores de fecalismo. En esta revisión se analizan los protozoarios “no patógenos” que habitan el tracto digestivo distal, las patologías informadas y los tratamientos sugeridos.