Hola! Creo que llego tarde a esta cuestión, pero por si ayuda a alguien agrego mi opinión. Soy ingeniero de sonido y acústica y leyendo el caso he pensado que el problema puede ser debido a que realmente el sonido del diapasón no es puro, sino que contiene varios armónicos (superiores e inferiores a la frecuencia principal de 440 Hz). Quizás el oído derecho no escucha la frecuencia principal (440 Hz) pero sí los armónicos, y esto es lo que provoca esta percepción de nota desafinada. Es decir, no es que se escuche desafinado, sino que no se escucha esta frecuencia en concreto. Creo interesante realizar el mismo experimento, pero con notas diferentes al La.
Saludos!