hola, no se si a estas alturas te podre ayudar o habras solucionado ya tu problema, pero aqui va mi respuesta. lo que tu tienes se llama sindrome de la cintilla iliotibial o comunmente como rodilla del corredor. esto se produce, aparte de por un mal calzado, por una actividad fisica intensa en un breve periodo de tiempo.
una mala pisada conlleva un exceso de tensión en esta zona de la rodilla, eso unido a una falta de adaptación de esas partes blandas provoca la irritación del tendón.
pasos a seguir, 1º reduce tu actividad física en un 80% y vas aumentandola progresivamente, 2º tira a la basura las zapatillas y comprate unas buenas acorde a tu pisada, 3ºcolocate hielo 2-3 veces al dia sobretodo despues del deporte, 4ºimportantisimo un buen calentamiento y aun mas el estiramiento depues (de toda la pierna), 5ºcuando corras usa en ambas piernas un taping circular, justo por debajo de la rotula (algo como lo que usaba nadal).
si el problema persisite te recomiendo que vayas a buen fisio especilizado en el deporte. aparte del tratamiento convencional vendria bien la puncion seca o electroacupuntura, tambien el kinesiotaping.
y por ultimo, si te gusta mucho el deporte y quieres seguir haciendo, deberias plantearte ir a un ortopeda y que te hagan unas plantillas a medida.
bueno espero que esto le pueda servir tambien a mas gente
un saludo.