Hola:Por los valores de LABORATORIO es un hipogonadismo hipergonadotrifico como bien pones, es decir que el problema esta en los testiculos, no en el eje hormonal. El cariotipo te lo pide para descartar Sindrome de Klinefelter que es un trastorno de origen genetico que tiene repercusion en la clinica..Testiculos pequeños, grasa de distribucion femenina, poco vello corporal..etc..pero te recominedo que todo esto lo hables con el endocrinologo, seguramente con la Testosterona te ira bien!! Soy medico clinico,
Un abrazo, fernando