Cuando hay inflamación de la pared instestinal, se altera la producción de enzimas por parte del intestino delgado, y algunos alimentos no son hidrolizados y absorvidos como sucede normalmente en este, y así llegan al colon donde son aprovechados y fermentados por las bacterias presentes en este, generando gases y sustancias irritantes que causan episodios de diarrea. Un desequilibrio de la flora intestinal (SIBO), comer poco sano, mucho gluten, el uso de antibioticos, sustancias irritante del sistema digestivo dañan la mucosa intestinal. por ejemplo el alcohol debilita o adelgaza esta, y son las bacterias beneficiosas las que producen sustancias desinflamantes, y reparadoras de la pared intestinal, y si faltan estas se va dañando y haciendo permeable, lo que genera otros problemas.