Buenas tardes Konel.
Lo más importante es el estado sanitario de tus perros. Si los tienes correctamente vacunados y desparasitados por dentro y por fuera como corresponde. Luego lógicamente la higiene como en todo, también es muy importante, sobre todo si llevas alimentos. Baño de los perros cada mes y cepillado diario. Lavado de las camitas, aspirado del coche, etc...
Todo contribuye a que no haya contagio de ninguna enfermedad. Pero si te quedas más tranquila una funda lavable tampoco estaría mal. ;)