Creo que se necesitan unos seis meses para que los anticuerpos salgan después de una relación de riesgo así que si han pasado ya tres años deberían salir positivos si tuvieras algo, si han salido negativos es que no hay nada .... de todos modos deberías haberlo preguntado al médico para quedarte tranquila.
El embarazo no creo influya en nada ya que precisamente la prueba del VIH se hace en todas las embarazadas por rutina, si interfiriera no se harían o se harían otras pruebas. Yo en tu lugar me quedaría tranquila.
Enhorabuena por el embarazo y que vaya todo muy bien .. ¿de cuanto tiempo estás??