Si cuando ese niño cumpla 10 u 11 años sigue teniendo su pene extremadamente pequeñito para su edad, deben llevarlo a un médico endocrinólogo o un médico urólogo (especialmente al primero), pues desde hace ya bastantes años hay tratamientos a base de testosterona inyectable (principal hormona sexual masculina), que administrados por cualquier médico a cualquier varón que aún no haya dejado de crecer (y hay muchachos que siguen creciendo hasta los 18 o 19 años, pero otros dejan ya de crecer con 13 o 14 años, por lo cual te digo que con 11 o 12 años es buena edad para que reciba esa clase de tratamientos a base de testosterona), consiguen hacer crecer ligeramente con cada tratamiento el tamaño de los órganos sexuales masculinos de ese muchacho (del tamaño de su pene y de sus testículos).
Puede ser que lo de tu hijo haya sido debido al defecto genético, o simplemente que haya dado la posibilidad de que ha salido con el pene así muy pequeñito, pero en cualquier caso, con esa clase de tratamientos, que bajo prescripción médica no tienen prácticamente ningun efecto secundario ni dañino para ese niño, se puede conseguir que el pene de tu hijo crezca lo suficiente como para compensar al menos en parte lo poquito que la naturaleza le dio. Es decir, no será actor porno, pero tal vez pueda tener una vida sexual medianamente normal se recibe varios tratamientos de esos a partir de esa edad que te he dicho, y hasta que haya dejado ya de crecer.
Mucha suerte.