Ese tipo de verrugas genitales se deben tratar en el dermatólogo más que en el urólogo. En cualquier caso he de decirte que existen diferentes tratamientos para su erradicación, no obstante la cirugía solo se da en casos extremos.
A mi novio también le pasó, es un sitio un poco complicado, ya que queda justo en el surco que deja la corona del glande. Además a él le ocurría que se lo tapa el prepucio (tiene prepucio) y le complicaba un poco la curación.
Te recomiendo que sigas las indicaciones del dr, y ya está