No, no creo que sea por el VPH, te convendria ir con el medico para que te mande estudios de laboratorio para saber si es un problema de Artritis Reumatoide (tienes antecedentes familiares con este problema?)o tambien un examen de exudado faringeo para ver si no tienes el Streptococo B Hemolitico que tambien provoca alteraciones en articulaciones, no te inquietes tanto con el VPH.
saludos.